对于真空冷冻干燥机的冷却固化过程，要解决两个问题，一个是冷却最终温度的确定；另一个是选择合适的降温程序。冷却固化过程的最终温度应当是完全固化温度，它应低于真空冷冻干燥机的共晶点温度，或玻璃化转化温度。冷却固化后的物料系统，实际上是既具有晶态，又具有玻璃态的的混合系统。为确定降温的最终温度，就要先测量真空冷冻干燥机的共晶点温度和玻璃化转化温度。

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